储存了1600个数字化心脏的大数据研究
人一 @ 2015.02.17 , 10:39 上午[-]
之前从没有这么多的人类心脏信息被收集储存
伦敦的医生们已经在电脑里以数据形式储存了1600个人类心脏。目的是通过比较心脏的详细信息和患者的基因来开发新的治疗方法。这个最新的研究项目需要储存使用庞大的数据信息。
这是一波新兴的“大数据”探险,试图从大数据中得出研究结果。
Hammersmith医院的医学研究委员会临床科学中心的科学家们扫描了1600位患者的心脏3D视频和并采集了他们的基因。主持这项心脏研究的Declan O'Regan博士说:与传统的小样本持续数年的临床研究试验相比,这种新方式可以发现更多的潜在信息。 他接着说:人类的基因和心脏病有着非常复杂的关联,我们仍然在研究它们的关联。通过得到真实清晰的心脏3D影像,我们希望能对心脏病的病因和影响有更好的理解,并对合适的病人在合适的时间里给予合适的药物。
微小症状
储存如此多的心脏信息是为了用于比较并得出导致心脏病的常见原因。O'Regan博士认为这类分析研究方法将成为将来医学界的常规。
通常有一些早于疾病发生的微小的症状,很难被发现,甚至我们不知道发现了什么。电脑可以非常敏锐地先于得病之前捕捉到这类微小症状。
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平方公里射电阵(SKA)收集到的数据将达到当前互联网数据年流量的150倍。
大数据概念正在覆盖诸多科学领域,需要涉及非常庞大的数据。
位于剑桥的欧洲生物信息研究所(EBI)已经储存了数万种动植物的全套基因代码。数据量相当于5000多台个人电脑的空间。
为了发现人类思维是如何工作的,南加州大学的神经影像信息研究所的学者们已经储存了30000张详细的大脑3D扫描,占据了相当于1万台个人电脑的空间。
座落于非洲和澳洲的平方公里射电阵一年收集的数据量达3*1014台电脑的空间。这是当前互联网全年流量的150倍。
数据革命
在圣何塞召开的美国科学促进协会(AAAS)会议上,研究者们讨论了如何储存和进一步筛选如此庞大的数据。
按照欧洲生物信息学研究所(EBI)的Ewan Birney教授的说法,大数据已经成为科学研究的新方式。 “突然间,我们不必害怕测量很多很多的事物——例如人类、海洋和宇宙,因为我们确信我们能够采集那些数据并从中获取答案。”他告诉BBC。
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仅加州一项有关详细扫描人类大脑通路的研究项目,就相当于10000台个人电脑的空间。
储存价格的下降有助于大数据的发展,但对于即将到来的海啸般增长的信息需求,人们显然还没有找到更好的压缩和储存方案。
还有一个问题是怎样组织和标志数据。如同图书管理员通过书籍类型或作者来分类管理图书一样,这个新兴科学正在开发如何逻辑性地分类数据,以便研究团队找到他们所需要的数据。但当考虑到数以万亿计的庞大数据并涉及复杂的科学领域,此任务远比图书管理更复杂。
英国生物技术和生物科学研究委员会(BBSRC)在AAAS会议上宣布出资745万英镑用于规划大数据的基础结构。
大数据的出现如同显微镜的发明一样重要,科学家通过这一强而有力的新工具来研究未被发现的错综复杂的自然过程。
接近全知
那些涉及大数据的研究将引领诸多科学领域改变研究方式。他们意识到进一步接近了知识的极限。原来通过有限的大脑和想象来知晓宇宙,现在这是一个的更好的办法。
照欧洲生物信息学研究所的Paul Flicek说法,大数据将会揭开重要研究道路的面纱。“科学研究并不总能让你有重大发现,发现你能发现的。但有了大数据,我们会发现新事物,并可以预知我们会发现什么。这是一个开放性的问题。”他告诉BBC。
用新方法管理和分析这些数据,是科学家们所面临的新挑战。仅仅收集数据并不能解决任何问题。
正确地组织管理大数据可以让科学家识别自然界的常见的微小事件,而这种微小事件对我们的生活却有巨大影响。希格斯玻色子(上帝粒子)就是通过这个方法被发现的。
“我们不打算减慢新数据的生成,”Flicek教授说道:“已经证明的是我们可以生产这些数据,我们能排列基因组。我们不会止步,很多激动人心的结果将被揭晓。”
“我们可以学习新事物,能看到过去前所未见的事物。”
附:希格斯玻色子,是粒子物理学标准模型预言的一种自旋为零的玻色子。物理学家希格斯提出了希格斯机制。在此机制中,希格斯场引起自发对称性破缺,并将质量予规范传播子和费米子。希格斯粒子是希格斯场的场量子化激发,它通过自相互作用而获得质量。2012年7月2日,美国能源部下属的费米国家加速器实验室宣布,该实验室最新数据接近证明被称为“上帝粒子”(The God Particle)的希格斯玻色子的存在。 2013年3月14日,欧洲核子研究组织(European Organisation for Nuclear Research)表示,先前探测到的新粒子是希格斯玻色子。2013年10月8日,诺贝尔物理学奖在瑞典揭晓,比利时理论物理学家弗朗索瓦·恩格勒和英国理论物理学家彼得·希格斯因希格斯玻色子的理论预言获奖。
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